Výzdobe dominuje obloženie z farebného mramoru, čo je typické pre toskánske stavby v románskom štýle. Obdivovať môžete veľmi krásne umelecky vytvorené vstupné dvere, na ktorých 6 rokov pracoval Andrea Pisano. Tieto dvere sú ozdobené 28 výplňami so scénami zo života sv. Jána Krstiteľa.
Severné dvere, ktoré vytvoril Lorenzo Ghiberti, sú dvere taktiež s 28 výplňami, na ktorých sú znázornené epizódy zo života Ježiša Krista, evanjelistov a cirkevných učiteľov. Ghiberti na týchto dverách pracoval neuveriteľných 21 rokov. Diela Andrea Pisana však neprekonal.
Na východnej strane babtistéria sú takzvné Rajské dvere, ktoré vytvoril Ghiberti a pracoval na nich 27 rokov. Na desiatich výplniach sú zobrazené scény zo Starého zákona. V tomto prípade sa jedná o kópiu. Originály môžete vidieť v múzeu Museo dell´ Opera del Duomo.